جداسازی DNA ژنومی از سلول باکتریایی :

تکنیک های زیادی برای جداسازی DNA ژنومی از سلول‌های باکتریایی در دسترس می باشد، اگرچه همه‌ی آن‌ها از گام‌های مشترکی مانند شکستن سلول، حذف پروتئین به دنبال آزادسازی ماده ژنتیکی پیروی می‌کنند. اولین هدف این آزمایش دستیابی به محصول DNA با کیفیت بالا می باشد که می‌توان آن را چندین سال تحت شرایط مناسب ذخیره کرد.

گام‌های مشترکی در استخراج DNA وجود دارد مانند: لیز‌کردن سلول و به دنبال آن حذف پروتئین، کربوهیدرات، RNA و غیره. تخریب دیواره سلولی و غشا معمولا با ترکیبی از آنزیم‌های مناسب (معمولا لیزوزیم) به منظور هضم دیواره سلولی و دترجنت‌ها برای تخریب غشا صورت می‌گیرد.

نمای شماتیکی از جداسازی DNA ژنومی از سلول‌های باکتریایی

دترجنت یونی بسیار رایجی که در این مرحله استفاده می شود سدیم دودسیل سولفات (SDS) می باشد. RNA معمولا به وسیله اضافه کردن RNase تجزیه می شود. نتیجه ی آن ایجاد الیگوریبونوکلئوتیدهایی می‌باشد که از DNA با وزن مولکولی بالا براساس محلولیت بیشتر آن در محلول ناقطبی (معمولا الکل\آب) جداسازی می‌شود. پروتئین ها با اضافه شدن پروتئیناز-K در معرض دناتوره شدن شیمیایی یا تجزیه آنزیماتیکی قرار می گیرند. متدوالترین تکنیکی حذف پروتئین از جمله دناتوراسیون و استخراج آن به فاز آلی به وسیله فنول و کلروفرم انجام می شود.