نوشته‌ها

پروتئین باکتریایی که موجب پیشرفت سرطان می شود | همه چیز در باره سرطان | علائم سرطان | درمان سرطان | سرطان ریه | سرطان خون | انواع سرطان | تاریخچه سرطان | سرطان PPT | سرطان PDF | بیوتکنولوژی | زیست فناوری امروزه تقریبا 20 درصد از سرطان ها به علت الودگی با عامل های خارجی مانند ویروس ها می باشد. مایکوپلاسما خانواده ای از باکتری ها می باشند که در ایجاد سرطان نقش دارد. پروتئین DnaK این باکتری در فعالیت پروتئین های مهم سلولی که در ترمیم DNA دخالت دارند مانند p53 تداخل ایجاد میکند. در نتیجه در سلول الوده شده به این باکتری، احتمال توسعه سرطان را افزایش می یابد.

پروتئین باکتریایی که موجب پیشرفت سرطان می شود

پروتئین باکتریایی که موجب پیشرفت سرطان می شود

امروزه تقریبا 20 درصد از سرطان ها به علت الودگی با عامل های خارجی مانند ویروس ها می باشد. مایکوپلاسما خانواده ای از باکتری ها می باشند که در ایجاد سرطان نقش دارد. پروتئین DnaK این باکتری در فعالیت پروتئین های مهم سلولی که در ترمیم DNA دخالت دارند مانند p53 تداخل ایجاد میکند. در نتیجه در سلول الوده شده به این باکتری، احتمال توسعه سرطان را افزایش می یابد.

پروتئین باکتریایی که موجب پیشرفت سرطان می شود | همه چیز در باره سرطان | علائم سرطان | درمان سرطان | سرطان ریه | سرطان خون | انواع سرطان | تاریخچه سرطان | سرطان PPT | سرطان PDF | بیوتکنولوژی | زیست فناوری امروزه تقریبا 20 درصد از سرطان ها به علت الودگی با عامل های خارجی مانند ویروس ها می باشد. مایکوپلاسما خانواده ای از باکتری ها می باشند که در ایجاد سرطان نقش دارد. پروتئین DnaK این باکتری در فعالیت پروتئین های مهم سلولی که در ترمیم DNA دخالت دارند مانند p53 تداخل ایجاد میکند. در نتیجه در سلول الوده شده به این باکتری، احتمال توسعه سرطان را افزایش می یابد.

A bacterial protein is found to promote cancer

Research suggests suggests that bacterial infections may contribute to far more cancers than previously thought

Date:
December 4, 2018
Source:
University of Maryland School of Medicine
Summary:
Researchers have discovered that DnaK, a protein of the bacterium mycoplasma, interferes with the mycoplasma-infected cell’s ability to respond to and repair DNA damage, a known origin of cancer. Journal Reference:
  1. Davide Zella, Sabrina Curreli, Francesca Benedetti, Selvi Krishnan, Fiorenza Cocchi, Olga S. Latinovic, Frank Denaro, Fabio Romerio, Muhammad Djavani, Man E. Charurat, Joseph L. Bryant, Hervé Tettelin, Robert C. Gallo. Mycoplasma promotes malignant transformation in vivo, and its DnaK, a bacterial chaperon protein, has broad oncogenic propertiesProceedings of the National Academy of Sciences, 2018; 201815660 DOI: 10.1073/pnas.1815660115
سیستم بیوهیبریدی در مخمر | بیوهیبرید | شیکیمیک اسید | داروسازی | ایندیوم فسفید | Light-driven fine chemical production in yeast biohybrids (bio-engineering.ir) | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | مهندسی علوم زیستی | زیست شناسی | بیولوژی

استفاده از سیستم بیوهیبریدی در مخمر به منظور تولید ترکیبات آلی پیچیده

استفاده از سیستم بیوهیبریدی در مخمر به منظور تولید ترکیبات آلی پیچیده

سیستم‌های تلفیقی زیستی و غیرآلی یا بیوهیبریدها یکی از دستاوردهای میان رشته‌ای است که هدف اصلی آن افزایش کارایی سیستم‌های زیستی به عنوان تولید کنندگان محصولات مختلف است. امروزه بیشترین کاربرد این مطالعات در افزایش راندمان تثبیت دی اکسید کربن یا تولید سوخت‌های زیستی توسط باکتری‌ها و مخمرها می‌باشد.

اصلی‌ترین محدودیت استفاده از بیوهیبریدها سمی بودن جزء غیر آلی برای ارگانیسم همراه و در مرحله بعد امکان تولید محصولات ساده شیمیایی است که استفاده از آنها را از لحاظ اقتصادی توجیه ناپذیر نموده است. اخیرا تیمی تحقیقاتی از انستیتو Wyss دانشگاه هاروارد آمریکا به کمک یک سیتم بیوهیبرید نوین موفق به افزایش سطح تولید شیکیمیک اسید shikimic acid به عنوان یکی از مهمترین پیش سازه‌های صنعت داروسازی شده است.

 

این محققان به کمک ترکیبات پلی فنولی سطح سلول‌های مهندسی شده مخمر را با استفاده از نانو ذرات نیمه هادی ایندیوم فسفید indium phosphide nanoparticles پوشانده‌اند. این ترکیبات بعد از جذب نور اقدام به انتقال الکترون به سیتوپلاسم سلول مخمری می‌نمایند، جایی که در آن از الکترونهای انتقال داده شده NADPH تولید خواهد شد و به این ترتیب نیاز مبرم سلول به NADPH به عنوان منبع انرژی مسیر تولید شیکیمیک اسید جبران می‌شود. میزان تولید متابولیت مذکور در این سیستم یازده برابر بیشتر از مخمرهای مهنسی شده به تنهایی است.
با انجام تحقیقات بیشتر بروی انواع ترکیبات نیمه هادی و تاثیر آنها بر ارگانیسم‌های مختلف می‌توان از نتایج حاصل از این تحقیق در تولید سایر محصولات آلی استفاده نمود.

دانلود مقاله

Light-driven fine chemical production in yeast biohybrids (bio-engineering.ir)

عضویت در کانال تلگرامی بیوتکنولوژی

سیستم بیوهیبریدی در مخمر | بیوهیبرید | شیکیمیک اسید | داروسازی | ایندیوم فسفید | Light-driven fine chemical production in yeast biohybrids (bio-engineering.ir) | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | مهندسی علوم زیستی | زیست شناسی | بیولوژی

سیستم بیوهیبریدی در مخمر | بیوهیبرید | شیکیمیک اسید | داروسازی | ایندیوم فسفید | Light-driven fine chemical production in yeast biohybrids (bio-engineering.ir) | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | مهندسی علوم زیستی | زیست شناسی | بیولوژی

استخراج آنتی بیوتیک | ترکیبات ضد باکتری | thanatin | لیپوپلی ساکارید | murepavadin | استخراج آنتی بیوتیک جدید از حشرات

استخراج آنتی بیوتیک جدید از حشرات

استخراج ترکیب آنتی بیوتیکی جدید از حشرات

پیدایش روز افزون باکتری‌های مقاوم به آنتی بیوتیک یکی از بزرگترین معضلات قرن حاضر در حوزه پزشکی است. استفاده تخصصی‌تر از آنتی‌بیوتیک‌ها و کشف ترکیبات ضد باکتری دو راه حل پیش روی انسان در مسیر مقابله با این چالش است. در مسیر پیداکردن ترکیبات جدید آنتی بیوتیکی چشم انداز محققان فراتر از منابع مرسوم آنها گسترش یافته تا به این وسیله شانس معرفی ترکیبات جدید را افزایش دهند.

اخیرا تیم تحقیقات دانشگاه زوریخ سوئیس موفق به جداسازی ترکیبی جدید تحت عنوان thanatin از یک نوع حشره آمریکایی به نام spined soldier bug شده‌اند که در ادامه تحقیقات خود اثرات ضد باکتریایی آن را نیز به اثبات رسانده‌اند. ویژگی بارز این ترکیب محل اثر اختصاصی آن می‌باشد که برای نخستین بار در جهان گزارش شده است. آنتی بیوتیک ساخته شده از این ترکیب که murepavadin نام گرفته و اکنون مراحل آزمایش بالینی را پشت سر می‌گذارد.

این آنتی بیوتیک از تجمیع کمپلس پروتئینی انتقال دهنده لیپوپلی ساکارید به غشای خارجی باکتری‌های گرم منفی جلوگیری نموده و از این طریق یکی از مهمترین سدهای دفاعی باکتری که همان غشای خارجی آن است را از بین می‌برد. کشف این ترکیب جدید می‌تواند شروعی بر معرفی انواع آنتی بیوتیک‌های مشتق از آن باشد تا به کمک آنها بر انواع باکتری‌های مقاوم و بیماری زا فائق آمد.

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

 

استخراج آنتی بیوتیک | ترکیبات ضد باکتری | thanatin | لیپوپلی ساکارید | murepavadin | استخراج آنتی بیوتیک جدید از حشرات

استخراج آنتی بیوتیک | ترکیبات ضد باکتری | thanatin | لیپوپلی ساکارید | murepavadin | استخراج آنتی بیوتیک جدید از حشراتفناو

درمان چاقی | Obesity | سرطان‌ | fibroblast growth factor | چاپرون | چاپرون مولکولی | کاهش سطح چربی | رفع اشکال الکتروفورز آگارز | الکتروفورز ژل آگارز | تئوری و مبانی کامل ژل الکتروفورز | آگارز | الکتروفورز | ژل الکتروفورز آگارز | Agarose Gel Electrophoresis

درمان چاقی مفرط با استفاده از یک پروتئین طبیعی

درمان چاقی مفرط با استفاده از یک پروتئین طبیعی

چاقی مفرط Obesity یکی از شایع‌ترین بیماری‌های دهه اخیر می‌باشد که بالغ بر 650 میلیون انسان را تحت تاثیر قرار داده است، این بیماری عامل اصلی انواع سندرم‌های اختلال متابولیک مانند مقاومت به انسولین، عدم تحمل گلوکز و فشار خون بالا است.

محققان دانشگاه Georgetown آمریکا حین کار بر روی خانواده پروتئینی fibroblast growth factor یا FGF و مطالعه نقش آنها در بروز انواع سرطان‌ها به صورت اتفاقی، پروتئینی به اسم FGFBP3 را یافتند که بر خلاف انتظار یک فاکتور کلیدی در کنترل راه‌های متابولیسمی به ویژه متابولیسم چربی‌ها و قندها است.

این پروتئین یک چاپرون مولکولی بوده و ضمن اتصال به پروتئین‌های خانواده FGF و بهبود تاخوردگی صحیح آنها، موجب افزایش کارایی این پروتئین‌ها، افزایش سطح متابولیسم چربی‌ها و به دنبال آن کاهش سطح چربی در خون می‌شود.

بیان نوترکیب این پروتئین در موش‌های مهندسی شده مستعد چاقی در تحقیقات preclinical موجب کاهش محسوس ذخایر چربی آنها شد. با توجه به حضور طبیعی این پروتئین در بدن و نقش آن، محققان امیدوارند با تکمیل مطالعات لازم به زودی مطالعات بالینی این پروتئین در انسان نیز پیگیری شود.

کانال تلگرامی بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

درمان چاقی | Obesity | سرطان‌ | fibroblast growth factor | چاپرون | چاپرون مولکولی | کاهش سطح چربی | رفع اشکال الکتروفورز آگارز | الکتروفورز ژل آگارز | تئوری و مبانی کامل ژل الکتروفورز | آگارز | الکتروفورز | ژل الکتروفورز آگارز | Agarose Gel Electrophoresis

درمان چاقی | Obesity | سرطان‌ | fibroblast growth factor | چاپرون | چاپرون مولکولی | کاهش سطح چربی

تولید سوخت‌های زیستی | bacterial microcompartments | سوخت زیستی | مهندسی علوم زیستی | به کار گیری باکتری‌ها در جهت تولید سوخت‌های زیستی

به کار گیری باکتری‌ها در جهت تولید سوخت‌های زیستی

به کار گیری باکتری‌ها در جهت تولید سوخت‌های زیستی

وجود ساختارهایی تحت عنوان bacterial microcompartments یا (BMCs) در باکتری‌ها ظرفیت بالایی را در استفاده از آنها به عنوان کارخانه‌های سلولی فراهم می‌آورد. این ساختارهای شبه-ارگان محل تجمع آنزیم‌های مختلف مسیرهای متابولیکی هستند که توسط ساختارهای پروتئینی شبیه به غشا پوشیده شده‌اند. با این وجود قراردادن آنزیم‌های مورد نظر در این بخش یا تغییر درآنها همواره یک مانع بزرگ در مسیر بهره برداری از آنها بوده است.

اخیرا داشمندان دانشگاه کنت انگلیس موفق به ابداع روشی شده‌اند که ضمن هدف گیری این بخش‌ از باکتری، امکان بکارگیری آنها در جهت تولید سوخت‌های زیستی و ساخت انواع واکسن‌ها را هم فراهم می‌آورد. در این روش محققان اقدام به طراحی پپتید‌هایی کردند که با اتصال به یکی از اجزای سطح BMC، امکان قرار دادن پروتئین هدف چه در داخل این بخش‌ها چه در سطح خارجی را فراهم می‌کند و به این ترتیب می‌توان از مسیرهای متابولیکی مهندسی شده مانند تخمیر قندها، در جهت رسیدن به اهداف مورد نظر استفاده کرد.

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

تولید سوخت‌های زیستی | bacterial microcompartments | سوخت زیستی | مهندسی علوم زیستی  | به کار گیری باکتری‌ها در جهت تولید سوخت‌های زیستی

تولید سوخت‌های زیستی | bacterial microcompartments | سوخت زیستی | مهندسی علوم زیستی | به کار گیری باکتری‌ها در جهت تولید سوخت‌های زیستی

نقشه برداری سه بعدی ژنوم انسان | ژنوم لامین‌های هسته‌ای | مارکرها | جابجایی کروموزوم‌ها | نقشه برداری سه بعدی هسته سلول | Illinois| لامین‌های هسته‌ای| tyramide signal amplification sequencing

نقشه برداری سه بعدی ژنوم انسان

نقشه برداری سه بعدی ژنوم انسان

با گذشت بیش از 20 سال از توالی یابی ژنوم انسان، هنوز زوایای پنهان بسیار زیادی در خصوص نحوه بسته بندی ژنوم در هسته سلول‌ها وجود دارد که روشن نشده است. به تازگی محققان دانشگاه Illinois ایالات متحده آمریکا موفق به ابداع روشی شده‌اند که به وسیله آن موقعیت دقیق مکانی هر ژن درون هسته را مشخص کرده و از این طریق نقشه سه بعدی آن را ارائه می‌دهند.

در این روش که tyramide signal amplification sequencing یا TSA-Seq نام دارد ابتدا اقدام به هدف گیری اجزای خاصی از هسته مانند لامین‌های هسته‌ای، به وسیله آنزیم horseradish peroxidase می‌کنند.

آنزیم اتصال یافته به این مارکرها سپس تولید ماده واکنش پذیر تیرامید می‌نماید که توانایی نشانه گذاری توالی های DNA نزدیک به خود را دارد و میزان شدت علامت گذاری با فاصله آن توالی از آنزیم نسبت معکوس خواهد داشت، از این طریق موقعیت فضایی همه ژن‌ها را به صورت هم زمان نسبت به مارکرهای خاص موجود در هسته تعیین می‌کنند.

محققان امیدوارند به وسیله نقشه برداری سه بعدی هسته سلول بتوانند به نقش جابجایی کروموزوم‌ها در بیان ژن‌ها و همچنین تاثیر این حرکات در بوجود آمدن انواع بیماری‌ها پی ببرند.

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

نقشه برداری سه بعدی ژنوم انسان | ژنوم لامین‌های هسته‌ای | مارکرها | جابجایی کروموزوم‌ها | نقشه برداری سه بعدی هسته سلول | Illinois| لامین‌های هسته‌ای| tyramide signal amplification sequencing

نقشه برداری سه بعدی ژنوم انسان | ژنوم لامین‌های هسته‌ای | مارکرها | جابجایی کروموزوم‌ها | نقشه برداری سه بعدی هسته سلول | Illinois| لامین‌های هسته‌ای| tyramide signal amplification sequencing

توليد بيوسنتتيك الياف تار عنكبوت | توليد تار عنكبوت | تار عنكبوت | دانشگاه واشنگتن آمريكا | نخ هاي بخيه | پروتئين هاي تار عنكبوت

 توليد بيوسنتتيك ألياف تار عنكبوت | توليد تار عنكبوت

 توليد بيوسنتتيك ألياف تار عنكبوت | توليد تار عنكبوت 

تار عنكبوت يكي از سخت ترين و درعين حال منعطف ترين الياف طبيعي شناخته شده در جهان محسوب ميشود به طوري كه سختي آنها با الياژهاي فولادي يا مواد ضد گلوله مقايسه مي گردد. تا كنون چندين ألياف مصنوعي از تار عنكبوت ساخته شده است كه متاسفانه خيلي به نمونه طبيعي خود شباهت نداشته است.

محققان دانشگاه واشنگتن آمريكا اخيراً موفق به ساخت اليافي شده اند كه علاوه بر خصوصيات كاملا مشابه با انواع طبيعي، چشم إنداز مناسبي را براي ارتقاع ويژگي هاي مطلوبتر ارائه ميدهد. آنها ضمن بيان ژن مربوط به پروتئين هاي تار عنكبوت در باكتري ها به صورت نوتركيب، اقدام به دست ورزي ويژه اي در اين توالي ها كرده اند تا ضمن حفظ حالت تكرار توالي ها، امكان تركيب پروتئن هاي حاصل از آنها را هم فراهم آورد.

اين ويژگي نوين امكان ساخت پروتئين هايي را فراهم مي كند كه به دليل داشتن اندازه مناسب، قدرت كشش و مقاومت بسيار بالايي را نشان ميدهند. ألياف بدست آمده از اين مطالعه به دليل قدرت مناسب و ويژگي زيست سازگاري امكان توليد نخ هاي بخيه، استفاده در صنعت پوشاك و همچنين جايگزيني با الياف شيميايي موجود در صنعت را دارد.

توليد بيوسنتتيك الياف تار عنكبوت | توليد تار عنكبوت  | تار عنكبوت | دانشگاه واشنگتن آمريكا  |  نخ هاي بخيه | پروتئين هاي تار عنكبوت

توليد بيوسنتتيك الياف تار عنكبوت | توليد تار عنكبوت | تار عنكبوت | دانشگاه واشنگتن آمريكا | نخ هاي بخيه | پروتئين هاي تار عنكبوت

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

كشف پروتئين هايي در بدن با خاصيت آنتي بيوتيكي | دانشگاه MIT آمريكا | خاصيت ضد ميكروبي | آنتي بيوتيک | کانال تلگرامی بیوتکنولوژی | ترمیم مینای دندان | مینای دندان | تولید کریستال مینا | دندان | آناتومی دندانها | دندان انسان | اسامی دندانها با شکل | انواع دندان | دندان چیست | ساختمان دندان |تعداد ریشه های دندان | دندان عقل

كشف پروتئينی با خاصيت آنتي بيوتيكي در بدن

كشف پروتئينی با خاصيت آنتي بيوتيكي در بدن

بدن انسان همانند تمامي ميكروارگانيسم ها به صورت طبيعي پروتئن هايي را توليد مي‌كند كه داراي نقش حفاظتي در بدن مي‌باشند. يكي از اهداف محققان استفاده از اين ظرفيت بالقوه به منظور كنترل بيماري هاي مختلف است. اخيراً دانشمندان دانشگاه MIT آمريكا با همكاري دانشگاه ناپل ايتاليا با استفاده از روش data-mining approach موفق به اثبات خاصيت ضد ميكروبي برخي از قطعات پپتيدي مانند قطعه اي از آنزيم پپسينوژن شده اند، اين آنزيم به صورت طبيعي در فرايند هضم غذا در معده نقش دارد.

آنها معتقداند با دست ورزي اين قطعه پپتيدي ميتوانند خاصيت ضد ميكروبي آن را افزايش داده و از آنها به عنوان آنتي بيوتيک در مقابله يا باكتري هاي مقاوم استفاده نمايند. بررسي هاي بيشتر بر روي اين پپتيد نشان دهنده خاصيت كشندگي آن در مقابل Salmonella ،E. coli و Pseudomonas aeruginosa است اين خاصيت هم در محيط اسيدي شبيه به معده و هم در محيط خنثي از نظر pH ديده مي‌شود.

در حالي كه مكانيسم دقيق ضد ميكروبي اين پپتيدها به خوبي شناخته نشده است، محققان معتقدند بار مثبت اين قطعات موجب اتصال آنها به غشاي بار منفي باكتري ها مي‌شود و سپس موجب ايجاد منافذي در غشا و در نتيجه مرگ باكتري ميشود. دانشمندان اميدوارند علاوه بر شناخت پپتيدهاي بيشتر با خاصيت مذكور بتوانند با اعمال دستكاري هاي ژنتيكي موجب ارتقاع اين خاصيت بشوند.

كشف پروتئين هايي در بدن با خاصيت آنتي بيوتيكي | دانشگاه MIT آمريكا | خاصيت ضد ميكروبي | آنتي بيوتيک | کانال تلگرامی بیوتکنولوژی | ترمیم مینای دندان | مینای دندان | تولید کریستال مینا | دندان | آناتومی دندانها | دندان انسان | اسامی دندانها با شکل | انواع دندان | دندان چیست | ساختمان دندان |تعداد ریشه های دندان | دندان عقل

كشف پروتئينی با خاصيت آنتي بيوتيكي | دانشگاه MIT آمريكا | خاصيت ضد ميكروبي | آنتي بيوتيک 

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

حذف پروتئین در مهره داران به کمک آنتی بادی سنتتیک جدید | حذف پروتئین | پروتئین‌های فلورسنت | GFP | آنتی بادی مصنوعی | آنتی بادی شتری | nanobody | ابداع روش نوین در تشخیص سرطان | تشخیص سرطان برپایه پروتئین مالاریایی | تشخیص سرطان | پروتئین مالاریایی | دانشگاه کوپنهاگن دانمارک | انگل مالاریا | بیومارکر | سلول‌های سرطانی

حذف پروتئین در مهره داران به کمک آنتی بادی سنتتیک جدید

“حذف پروتئین” در مهره داران به کمک آنتی بادی سنتتیک جدید

روش اصلی برای مطالعه نقش بیولوژیکی پروتئین‌ها اتصال آنها به پروتئین‌های فلورسنت (GFP) می‌باشد تا از این طریق و به کمک میکروسکوپ، آنها را در سلول‌های زنده مطالعه نمایند. با این وجود تعیین دقیق نقش هر پروتئین گاهی اوقات نیازمند حذف کامل آن از سلول و مشاهده نتایج حاصل از این حذف است.

محققین موسسه تحقیقاتی TU Dresden و Max Planck آلمان در یک همکاری مشترک موفق به ساختن آنتی بادی مصنوعی شده‌اند تا به وسیله آن مطالعات عملکردی پروتئین‌ها را تسهیل نمایند. آنتی بادی جدید با الحاق توالی تشخیص دهنده اکسین (AID) به یک آنتی بادی تشخیصی GFP که از لحاظ ساختاری شبیه آنتی بادی شتری (nanobody) می باشد، بدست آمده است.

در این روش علاوه بر رهگیری پروتئین‌های متصل به GFP می‌توانند در صورت اضافه شدن اکسین به محیط کشت سلولی، آنها را به طور کامل نابود کنند. در حالی که تمامی روش‌های از کار انداختن پروتئین‌ها (knockout) امروزه مبتنی بر تغیرات ژنتیکی است و معمولا موجوداتی که به این روش مهندسی شده‌اند قابلیت بقا ندارند. آنتی بادی جدید طراحی شده می‌تواند به صورت شرطی و در زمان دلخواه پروتئین مورد نظر را از کار بندازد.آنتی بادی مصنوعی جدید موجب “حذف پروتئین” شرطی پروتئین مهره داران می‌شود

روش اصلی برای مطالعه نقش بیولوژیکی پروتئین‌ها اتصال آنها به پروتئین‌های فلورسنت (GFP) می‌باشد تا از این طریق و به کمک میکروسکوپ، آنها را در سلول‌های زنده مطالعه نمایند. با این وجود تعیین دقیق نقش هر پروتئین گاهی اوقات نیازمند حذف کامل آن از سلول و مشاهده نتایج حاصل از این حذف است.

محققین موسسه تحقیقاتی TU Dresden و Max Planck آلمان در یک همکاری مشترک موفق به ساختن آنتی بادی مصنوعی شده‌اند تا به وسیله آن مطالعات عملکردی پروتئین‌ها را تسهیل نمایند. آنتی بادی جدید با الحاق توالی تشخیص دهنده اکسین (AID) به یک آنتی بادی تشخیصی GFP که از لحاظ ساختاری شبیه آنتی بادی شتری (nanobody) می باشد، بدست آمده است.

در این روش علاوه بر رهگیری پروتئین‌های متصل به GFP می‌توانند در صورت اضافه شدن اکسین به محیط کشت سلولی، آنها را به طور کامل نابود کنند. در حالی که تمامی روش‌های از کار انداختن پروتئین‌ها (knockout) امروزه مبتنی بر تغیرات ژنتیکی است و معمولا موجوداتی که به این روش مهندسی شده‌اند قابلیت بقا ندارند. آنتی بادی جدید طراحی شده می‌تواند به صورت شرطی و در زمان دلخواه پروتئین مورد نظر را از کار بندازد.

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

لینک مقاله

اسپرم | تخمک | انستیتو پاستور | Arabidopsis thaliana | تکامل | HAP2 | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست | سعید کارگر | جزئیات مولکولی لقاح تخمک و اسپرم

جزئیات مولکولی لقاح تخمک و اسپرم

جزئیات مولکولی لقاح تخمک و اسپرم

لقاح بین اسپرم و تخمک نخستین مرحله آغاز حیات فردی محسوب می‌شود که با وجود نقش مهم آن، هنوز به خوبی شناخته شده نیست. به تازگی همکاری بین محققان دانشگاه براون آمریکا و انستیتو پاستور پاریس فرانسه منجر به شناسایی پروتئینی در سطح سلول‌های اسپرم شده‌ است که نقش آغازگری در فرایند لقاح را ایفا می‌کند.

محققان با بررسی پروتئین‌های سطح اسپرم گیاه Arabidopsis thaliana موفق به یافتن این پروتئین شده‌اند. بررسی ژنوم گونه‌های مختلف حضور پروتئین که HAP2 نام گرفته است را در انواع گیاهان، حشرات، قارچ‌ها و برخی از حیوانات نیز به اثبات رسانده‌ است هر چند که مقایسه ژنومی حضور ژن کد کننده این پروتئین را در انسان تایید نکرده است.

محققان دلیل احتمالی فقدان این پروتئین در انسان را جهش‌های صورت گرفته طی تکامل می دانند و از این رو بر آن شدند تا پس از جداسازی و خالص نمودن این پروتئین اقدام به شناسایی ساختار سه بعدی آن کنند. یافته‌های حاصل از کار آنها و مقایسه ساختاری پروتئین‌ها حضور پروتئینی با ساختار و عملکرد مشابه در پروتوزوا را نشان می‌دهد که هر دو دارای موتیف‌های کاملا حفاظت شده در ناحیه راسی خود هستند.

یافته‌های حاصل ازا این پژوهش علاوه بر آشکار کردن نواحی حفاظت شده در پروتئین نفوذ کننده یک بار دیگر اهمیت حفاظت conservation در سطح ساختاری را به جای توالی ژنی نشان داده و همچنین امیدها برای یافتن پروتئین مشابه در انسان را بیشتر می‌کند.

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی

 لینک خبر

اسپرم  | تخمک | انستیتو پاستور | Arabidopsis thaliana | تکامل | HAP2 | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست | سعید کارگر | جزئیات مولکولی لقاح تخمک و اسپرم

اسپرم | تخمک | انستیتو پاستور | Arabidopsis thaliana | تکامل | HAP2 | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست | سعید کارگر | جزئیات مولکولی لقاح تخمک و اسپرم

بهبود تجزیه و تحلیل سلول به روش جدید | درمان سرطان | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | سعید کارگر | بیوتکنولوژی پروتئین | میکروسکوپ ایمونوفلورسانس | زیست شناسی | مهندسی علوم زیستی | دکتر سعید کارگر

بهبود تجزیه و تحلیل سلول به روش جدیدی در میکروسکوپ ایمونوفلورسانس

 

بهبود تجزیه و تحلیل سلول به روش جدیدی در میکروسکوپ ایمونوفلورسانس

تعیین محل پروتئین ها در میان سلول ها و بافت ها به وسیله ی میکروسکوپ های ایمونوفلورسانس موجب توسعه و پیشرفت در زیست شناسی سلولی شده است.

دانشمندان روش جدیدی را توسعه دادند که تعداد پروتئین هایی را که در هر نمونه می توان تشخیص داد 10 برابر روش های پیشین است. این روش پربازده می تواند بیش از 40 پروتئین مختلف در نمونه های بیولوژیکی همراه با مکان آن ها را تشخیص بدهد.

این روش اطلاعاتی در مورد مقدار سطح بیان پروتئین ها در هزارن سلول تکی به طور همزمان، جزئیات توزیع آن در قسمت های مختلف سلول و اندامک های سلولی در هر سلول و محل تمام این اطلاعات در میان یک زمینه چند سلولی را به ما میدهد.

الگوریتم تصویری کامپیوتری این اطلاعات موجب می شود تا بتوان به پروفایلی از نقشه پروتئین های درون سلولی در پاسخ به محتوای دارویی مختلف که قابل کاربرد برای برای درمان سرطان می باشند، شرایط سلولی مختلف و… دست یافت.

 

دانلود مقاله

کانال بیوتکنولوژی وان

سایت مهندسی علوم زیستی 


بهبود تجزیه و تحلیل سلول به روش جدید | درمان سرطان | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | سعید کارگر | بیوتکنولوژی پروتئین | میکروسکوپ ایمونوفلورسانس | زیست شناسی | مهندسی علوم زیستی | دکتر سعید کارگر

New method refines cell sample analysis

Date:
August 2, 2018
Source:
University of Zurich
Summary:
Innovation in the field of biomedicine: Researchers have developed a novel method which increases more than tenfold the number of proteins that can be visualized per sample, making it possible to generate a comprehensive map of cellular organization across the various cellular states. This highly sophisticated and refined view can be used to advance precision medicine and is already being applied in cancer medicine
اثر دما در تعیین جنسیت در لاک پشت | ترمومتر بیولوژیکی | سعید کارگر | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست فن آوری| How turning down the heat makes a baby turtle male | Scientists start to crack 50-year puzzle of how temperature influences a hatchling's sex

کشف مکانسیم مولکولی تاثیر دما در تعیین جنسیت لاک پشت | زیست فناوری

How turning down the heat makes a baby turtle male

Scientists start to crack 50-year puzzle of how temperature influences a hatchling’s sex

ترمومتر بیولوژیکی

دانشمندان بلاخره موفق شدند معمای یک ۵۰ ساله را حل بکنند،  “چگونه دما، بچه لاک پشت را نر یا ماده میکند”. محققین نشان دادند تخم مرغ هایی که در دمای پایین انکوبه گذاری می شوند ژنی بنام kdm6b را در اندام جنسی لاک پشت نابالغ روشن میکند.
اولین بار این پدیده که دما در تعیین جنسیت لاک پشت تاثیر می گذارد، ۵۰ سال پیش کشف شد اما جزئیات مولکولی آن تا به امروز مخفی بود. در مقاله ای که در 11 May در ژورنال Science منتشر شد، محققین‌ سرانجام توانستتد نقش کلیدی ترمومتر بیولوژیکی را در توسعه لاک پشت نر و ماده تشخصی بدهند.

تعیین جنسیت وابسته به دما برای مدت ها یک پازل بود. این اولین مدرک کاربردی است که یک پیوند مولکولی بین دما و نوع جنسیت ایجاد میکند. برخلاف انسان و بسیاری از حیوانات، جنسیت لاک پشت، تمساح، مارمولک ها به وسیله کروموزم هایی که به ارث میبرند تعیین نمی شود بلکه وابسته به درجه حرارت محیط می باشد.

اثر دما در تعیین جنسیت در لاک پشت | ترمومتر بیولوژیکی | سعید کارگر | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست فن آوری| How turning down the heat makes a baby turtle male | Scientists start to crack 50-year puzzle of how temperature influences a hatchling's sex

اثر دما در تعیین جنسیت در لاک پشت

زمانی که تخم لاک پشت در دمای ۳۲ درجه سیلیوس انکوبه گذاری می شود، تمام زاده ها ماده می شوند و زمانی که در دمای ۲۶ درجه سیلیوس انکوبه گذاری می شود تمام زاده ها نر می شوند.
در این مطالعه محققین نشان دادند که تخم های در دمای سردتر انکوبه شده اند ژن Kdm6b در اندام های جنسی نابالغ آن ها فعال می شودو جانور نر تولید می شود. این ژن در دما بالاتر تقریبا غیرفعال می شود و جانور ماده تولید می شود. این ژن پروتئینی تولید می کند که با قسمتی از ژنوم بنام Dmrt1 واکنش می دهد و موجب توسعه بیضه ها می شود.

ژن kdm69 با ژن Dmrt1 را با حذف تگ های مهارکننده و دنباله های هیستونی فعال می کند که موجب می شود ژن های این قسمت راحت تر در دسترس باشند و خوانده بشوند.

 

دانلود مقاله کشف مکانسیم مولکولی تاثیر دما در تعیین جنسیت لاک پشت زیست فناوری

نویسنده : سعید کارگر

کانال تلگرامی بیوتکنولوژی

عضویت در کانال بیوتکنولوژی پیام رسان سروش

مخمر رودوتورولا | بیوریمیدیشن آلودگی های رادیواکتیو به وسیله مخمر | زیست فناوری | بیوتکنولوژی | بیوتکنولوژی میکروبی

مخمر ممکنه راه حل آلودگی های رادیواکتیو باشد | زیست فناوری

مخمر ممکنه راه حل آلودگی های رادیواکتیو باشد (بیوریمیدیشن) | زیست فناوری

Yeast may be the solution to toxic waste clean-up

در دوران جنگ سرد نزدیک به ۴۶ هزار سلاح هسته ای تولید شد که نتیجه آن حجم بالایی از آلودگی محیط با زباله های مایع رادیواکتیو اسیدی بود.

مخمر رودوتورولا

مطالعات جدید نشان میدهد که مخمر رودوتورولا پتانسیل بالا و مقرون به صرفه ای در بیوریمیدیشن زباله های رادیواکتیو دارد.

مخمر با پیگمنت قرمز؛ رودوتورولا (Rhodotorula taiwanensis MD1149) بسیار مقاوم در برابر عوارض حاد و مزمن پرتو گاما، فلزات سنگین و اسید می باشد.
این ویژگی های برای بیوریمیدیشن (پاکسازی محیط بوسیله میکروارگانیسم ها) ضروری می باشد. بعد از توالی یابی کل ژنوم این میکروارگانیسم محققین متوجه شدند که این میکروارگانیسم مانند داینوکوکوس (Deinococcus radiodurans) به رادیواکتیو مقاوم می باشد.

مقالات زیادی راجب به باکتری دادینوکوکوس برای پاکسازی آلودگی رادیواکتیو منتشر شده است اما مکان های آلوده بیش از اندازه اسیدی هستند و این باکتری توانایی رشد در آن شرایط را ندارد. مطالعات نشان میدهد که مخمر رودوتورولا بیشتر مناسب می باشد و می تواتد شرایط اسیدی و فلز سنگین را بهتر تحمل کند.

 

نویسنده : سعید کارگر

دانلود مقاله یوریمیدیشن آلودگی های رادیواکتیو به وسیله مخمر

کانال تلگرامی بیوتکنولوژی

عضویت در کانال بیوتکنولوژی پیام رسان سروش

ساخت ابریشم فلورسنت قرمزی که باکتری های پاتوژن را می کشد.

Far-red fluorescent silk can kill harmful bacteria as biomedical and environmental remedy

ابریشم فلورسنت قرمز می تواند باکتری های مضر را بکشد میتوان از آن به عنوان چاره ای برای زیست پزشکی و زیست محیطی استفاده کرد.
محققین ژن mKate2 که سازنده پروتئین فلورسنت قرمز می باشد؛ درون میزبان ابریشم وارد کردند. تابش نور سبز موجب تولید گونه های فعال اکسیژن (ROS) می شود، که رادیکال های موثری برای از بین بردن آلودگی های ارگانیک و حمله به غشا و DNA پاتوژن ها می باشد.

ساخت ابریشم فلورسنت قرمزی که باکتری های پاتوژن را می کشد. ابریشم فلورسنت | پروتئین فلورسنت قرمز | سعید کارگر | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست فن آوری

ساخت ابریشم فلورسنت قرمزی که باکتری های پاتوژن را می کشد.
ابریشم فلورسنت | پروتئین فلورسنت قرمز
| سعید کارگر | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست فن آوری

زمانی که باکتری اکلای موجب بر روی این ابریشم فلوسنت به مدت ۶۰ دقیقه در معرض تابش نور سبز قرار میگیرد، نرخ باکتری های زنده ۴۵ درصد کاهش می یابد. محققین متوجه شدند که می توانند از این ابریشم برای فیلم، باند یا پارچه استفاده کرد.

Date: April 19 ,2018
journal : Advanced Science
Summary:
A silk hybrid material attacks bacteria when illuminated by a green light, thanks to a far-red fluorescent protein researchers transferred to its genetic makeup.

نویسنده : سعید کارگر

ساخت ابریشم فلورسنت قرمزی که باکتری های پاتوژن را می کشد. ابریشم فلورسنت | پروتئین فلورسنت قرمز | سعید کارگر | بیوتکنولوژی | زیست فناوری | زیست فن آوری

ساخت ابریشم فلورسنت قرمزی که باکتری های پاتوژن را می کشد.

لینک مقاله

Green Light Activated Photoreaction via Genetic Hybridization of Far-Red Fluorescent Protein and Silk

کانال تلگرامی بیوتکنولوژی