رفع اشکال الکتروفورز آگارز

رفع اشکال الکتروفورز آگارزمشکلات الکتروفورز DNA و دلایل احتمالی آن ها

مشکل: شدت پایین همه یا تعدادی از باندهای DNA

دلایل احتمالی:‌

  • بارگذاری مقدار کم DNA Ladder
  • رنگ آمیزی ناکافی و یا ناهمگون
  • خارج شدن DNA از ژل
  • نفوذ و پخش شدن DNA در ژل
  • پوشیده شدن DNA توسط رنگ های مورد استفاده در رنگ آمیزی

مشکل:‌ الگوهای باند غیر معمول

دلایل احتمالی:

  • قبل از باگیری DNA مارکر گرم نشد.
  • دناتوره شدن DNA
  • شرایط بارگیری متفاوت برای نمونه DNA و مارکر DNA
  • شرایط نا مناسب الکتروفورز
  • استفاده از درصد ناصحیح ژل و یا بافر
  • مهاجرت غیر معمول به دلیل توالی ها و یا ساختارهای مختلف DNA
  • اثر GEL SHIFT
  • غلظت بالای نمک در نمونه ها

مشکل: اسمیر شدن باندها

دلایل احتمالی:

  • تجزیه شدن DNA توسط نوکلئازها
  • شرایط نا مناسب الکتروفورز
  • اثر GEL SHIFT
  • بارگزاری بیش از اندازه DNA
  • غلظت بالای نمک در نمونه
  • شکل­گیری نامناسب چاهک های ژل

مشکل:‌ باندهای منحنی شکل DNA

دلایل احتمالی:‌

  • ژل به طور کامل در بافر الکتروفورز قرار نگرفته است.
  • حجم نمونه ها کم می باشد.
  • شرایط عمل الکتروفورز نامناسب است.
  • حباب ها و یا ذرات بزرگی در چاهک های ژل و یا خود ژل موجود می باشند.

مشکل:‌ باقی ماندن DNA در چاهک

دلایل احتمالی:

  • شکل گیری نا مناسب چاهک های ژل
  • بارگیری بیش از اندازه DNA
  • آلوده شدن نمونه DNA
  • اثر GEL SHIFT

مشکل:‌ تعیین مقدار غلظ

دلایل احتمالی:‌

  • شرایط بارگیری متفاوت بین مارکر DNA و نمونه ها
  • تعیین باند غلظ مارکر برای تعیین مقدار نمونه
  • استفاده از روش تعیین مقدار نامناسب
  • رنگ امیزی ناهمگون ژل و نیز رنگ شدن پس زمینه نیز می تواند بر نتایج تعیین مقدار ژل اثر بگذارد.
  • پوشیده شدن DNA توسط رنگ های مسیریابی

مطالب مرتبط با آگارز ژل آلکتروفورز

یک دیدگاه

  1. لطفا میخواستم عضو سایت وکانال تلگرامی شوم ولی موفق نشدم اگر مقدور است خودتان زحمتش را بکشید سپاس.
    شماره همراه:09129289607

افزودن یک دیدگاه

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *